目前的研究认为间充质干细胞治疗帕金森病的可能机制有：

间充质干细胞移植入脑后，能形成表达神经标志性蛋白如nestin的神经元样细胞(neuron-like cells)或星形胶质细胞，产生的细胞可在受损部位周围存活甚至移行至全脑。

间充质干细胞在中枢神经系统Niche下能分泌脑源性神经营养因子、碱性成纤维细胞生长因子等营养因子，或者刺激损伤部位产生内源性生长因子，促进损伤组织的修复并减少细胞凋亡。

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间充质干细胞是受损部位新生血管的主要组成细胞，可分化成血管内皮细胞和细胞外基质，帮助神经保护、促进血管新生。

在脑内创造适宜的局部微环境，通过体外扩增或不同因子诱导分化的方法使间充质干细胞分化为神经细胞后进行移植，替代受损细胞重建神经功能区和传导通路。本中心的临床结果表明，脐带间充质干细胞移植治疗，在短期内能部分改善帕金森患者的震颤、强直，但未观察到对运动迟缓、体位不稳等症的有效改善。

其原因主要考虑观察期短，干细胞进入颅内后最大作用的发挥是一个长期过程。故拟在随访期内对患者症状的改善作一追踪，要求患者定期复诊，除UPDRS量表评分外，可结合PET显像示氟多巴的摄取有无增加，对疗效进行客观评定。

与现有的医疗和手术治疗的帕金森病相比，干细胞疗法代表一种进步的治疗方案，已成为临床上具有竞争力的新疗法，现有研究表明其能促使长期持久地，大幅改善运动障碍，阻断疾病进程。