1. 归巢效应：干细胞通过向受损神经及痛觉传导通路发生迁移后发挥生物学作用，形成干细胞的“归巢”效应。

2. 分化为神经细胞：干细胞在“归巢”后分化为特定神经元或神经胶质细胞替代受损神经细胞，发挥神经修复作用。

3. 分泌神经营养因子：干细胞通过分泌 GDNF、NT-3、b FGF 及 NRG-1 等神经营养因子，促进受损神经元及神经胶质细胞存活与功能修复，从而缓解神经病理性疼痛。

4. 抑制神经胶质细胞活化与炎症反应：干细胞移植通过抑制小胶质细胞及星形胶质细胞活化来减少促炎因子如 IL-1β及IL-17释放，增加抗炎因子如IL-10表达，抑制iNOS活性，减轻炎症反应来缓解神经病理性疼痛。

干细胞治疗的临床应用为很多不可治愈的神经性疾病带来新的方法。除了细胞替代之外，干细胞通过免疫调节、营养作用、神经保护或血管发生的刺激都有一定的临床应用价值。干细胞在改善患者症状和生活质量方面具有巨大潜力，弥补了传统医学没有提供有效治疗的不足。