越来越多的研究使用干细胞来进行疾病治疗的探索，并且取得了积极的临床疗效，这也就使得干细胞成为了许多疾病治疗的新希望。

很多人类疾病与特定器官、组织、细胞的病变或受损密切有关，如心血管疾病、糖尿病、帕金森、卵巢早衰、肝硬化等。

目前临床治疗一些难治性疾病往往只能控制或延缓病情，但对疾病中发生损伤的组织和器官部位却是无能为力，因此理想的状态是移植功能正常的细胞、组织和器官来替代发生受损的部位。

如今临床上进行的替代治疗多来自于供体捐献，然而供体来源匮乏是当前替代治疗面临的最大困境，寻找新的移植物来源成为当务之急。干细胞技术的发展，有望解决这一困境。

干细胞被用于许多疾病包括

◆骨关节炎

◆急性和慢性运动损伤

◆慢性阻塞性肺疾病(COPD)

◆自身免疫性疾病就像类风湿性关节炎和系统性红斑狼疮的红斑和其他人

◆周围神经病变

◆血管疾病

◆胃肠疾病如克罗恩氏病和溃疡性结肠炎

◆神经系统紊乱就像多发性硬化症，帕金森病，中风，阿尔茨海默病和其他

◆泌尿道的疾病就像佩罗尼氏病和勃起功能障碍