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干细胞是一类具有自我复制能力的多潜能细胞，通过干细胞移植来生成有功能的卵母细胞和卵泡细胞，成为了治疗卵巢早衰的新思路。

科学研究发现，间充质干细胞或有多种修复机制，包括分泌多种细胞因子，抑制细胞凋亡及修复受损组织细胞；它能定植于受损部位，进行分化，部分地补偿或替代修复其功能；通过免疫调节作用抑制机体的免疫反应，促进受损组织的自身修复;通过修复卵巢间质，防止卵巢纤维化，从而保护受损卵巢。

干细胞进入卵巢后，可直达损伤部位，分化成部分血管内皮细胞，提供营养支持;通过改变一部分基因表达，达到调控卵巢功能的目的。

间充质干细胞有多种来源，包括骨髓、脂肪、脐带以及胎盘等组织，其中脐带和胎盘间充质干细胞是最原始、最纯净的干细胞最佳来源。并且随着研究的进展，人们发现胎盘以及脐带来源的间充质干细胞具有更大的优势，它们在卵巢早衰的研究中展现出了巨大潜力。

2017年，美国《分子治疗》杂志报告称：动物实验显示，干细胞疗法有望安全地治疗卵巢早衰。

目前，脐带、胎盘间充质干细胞治疗卵巢早衰的临床研究在国内也取得了很大的突破，有些成功案例尚属全球首例。