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1、替代和修复死亡和受损伤的细胞

这些细胞具有自动归巢的特点，注入人体后，可聚集至受损器官及相关部位，并分化成特定细胞。干细胞注入人体后，新细胞和组织在目标组织的微环境下生长，受损组织得到修复。利用干细胞自身分化功能生长新组织细胞，弥补组织细胞老化、死亡、损伤，使病变组织和细胞恢复正常。加入新血管，形成微循环，改善损伤组织。

2、旁分泌作用

在向组织内注入干细胞后，可产生多种生物活性因子，如神经营养因子、抗凋亡因子等多种因子(如神经营养因子、细胞因子)、调节肽、气体信号分子等，并能对周围细胞起作用。能促进细胞增殖，抑制功能细胞凋亡，将现有组织祖细胞分化为组织细胞，修复受损组织，生长新组织。

3、激活休眠和处于抑制状态的细胞

机体的生长和发育是通过细胞分裂来完成的，当细胞分裂时，一部分脱离了正常的细胞周期，表现为功能性睡眠。有些细胞受内因子的影响，生长受抑制。这类处于休眠或被抑制状态的细胞不再分裂、增殖，仅进入老化代谢过程，导致人体新生细胞减少，新陈代谢减慢，人体进入衰老阶段。随着年龄的增长，干细胞将年轻的信号传递给脱离细胞周期的成年细胞。休眠及受干细胞刺激的抑制态细胞激活后，再进入细胞周期，通过分裂增殖，增加体内新生细胞数，使人体代谢过程恢复正常甚至逆转。